Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RUBCNQ92622 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RUBCNQ92622 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUBCNQ92622 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms