Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATL1Q8WXF7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATL1Q8WXF7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATL1Q8WXF7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms