Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF31Q8WWY3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF31Q8WWY3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF31Q8WWY3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms