Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPIRE2Q8WWL2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPIRE2Q8WWL2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms