Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSMCE1Q8WV22 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSMCE1Q8WV22 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSMCE1Q8WV22 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms