Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DEPDC1BQ8WUY9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DEPDC1BQ8WUY9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEPDC1BQ8WUY9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms