Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRSK1Q8TDC3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRSK1Q8TDC3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms