Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CCER1Q8TC90 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CCER1Q8TC90 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCER1Q8TC90 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms