Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GADD45GIP1Q8TAE8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GADD45GIP1Q8TAE8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GADD45GIP1Q8TAE8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms