Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP61Q8NHU2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP61Q8NHU2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP61Q8NHU2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms