Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHDC9Q8NEP7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHDC9Q8NEP7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHDC9Q8NEP7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHDC9Q8NEP7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms