Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AGBL3Q8NEM8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AGBL3Q8NEM8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AGBL3Q8NEM8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGBL3Q8NEM8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGBL3Q8NEM8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGBL3Q8NEM8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGBL3Q8NEM8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGBL3Q8NEM8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGBL3Q8NEM8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AGBL3Q8NEM8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AGBL3Q8NEM8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AGBL3Q8NEM8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AGBL3Q8NEM8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AGBL3Q8NEM8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AGBL3Q8NEM8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AGBL3Q8NEM8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AGBL3Q8NEM8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
AGBL3Q8NEM8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
AGBL3Q8NEM8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms