Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM7

SUPT20H, Transcription factor SPT20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20HQ8NEM7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT20HQ8NEM7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT20HQ8NEM7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SUPT20HQ8NEM7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SUPT20HQ8NEM7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SUPT20HQ8NEM7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SUPT20HQ8NEM7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUPT20HQ8NEM7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SUPT20HQ8NEM7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUPT20HQ8NEM7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms