Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM35BQ8NCS4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM35BQ8NCS4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM35BQ8NCS4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms