Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POMGNT2Q8NAT1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POMGNT2Q8NAT1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POMGNT2Q8NAT1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POMGNT2Q8NAT1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POMGNT2Q8NAT1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POMGNT2Q8NAT1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POMGNT2Q8NAT1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POMGNT2Q8NAT1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POMGNT2Q8NAT1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POMGNT2Q8NAT1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POMGNT2Q8NAT1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms