Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TTC29Q8NA56 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC29Q8NA56 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms