Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ANKRD42Q8N9B4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD42Q8N9B4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD42Q8N9B4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms