Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC89Q8N998 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC89Q8N998 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms