Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms