Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAF1Q8N7H5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAF1Q8N7H5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAF1Q8N7H5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms