Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5C6

SRBD1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 995 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRBD1Q8N5C6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRBD1Q8N5C6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRBD1Q8N5C6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRBD1Q8N5C6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms