Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRACR2BQ8N4Y2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms