Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2U9

PQLC1, PQ-loop repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1Q8N2U9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PQLC1Q8N2U9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PQLC1Q8N2U9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PQLC1Q8N2U9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PQLC1Q8N2U9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PQLC1Q8N2U9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PQLC1Q8N2U9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PQLC1Q8N2U9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PQLC1Q8N2U9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PQLC1Q8N2U9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PQLC1Q8N2U9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PQLC1Q8N2U9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PQLC1Q8N2U9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PQLC1Q8N2U9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PQLC1Q8N2U9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PQLC1Q8N2U9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PQLC1Q8N2U9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PQLC1Q8N2U9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PQLC1Q8N2U9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PQLC1Q8N2U9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms