Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EID3Q8N140 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EID3Q8N140 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EID3Q8N140 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms