Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC117Q8IWD4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC117Q8IWD4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms