Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC50Q8IVM0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC50Q8IVM0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms