Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
P3H3Q8IVL6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
P3H3Q8IVL6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
P3H3Q8IVL6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
P3H3Q8IVL6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
P3H3Q8IVL6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
P3H3Q8IVL6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
P3H3Q8IVL6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
P3H3Q8IVL6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
P3H3Q8IVL6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
P3H3Q8IVL6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
P3H3Q8IVL6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
P3H3Q8IVL6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
P3H3Q8IVL6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
P3H3Q8IVL6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
P3H3Q8IVL6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
P3H3Q8IVL6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
P3H3Q8IVL6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
P3H3Q8IVL6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
P3H3Q8IVL6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC37.79■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC37.78■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
P3H3Q8IVL6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
P3H3Q8IVL6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms