Protein–RNA interactions for Protein: Q86X55

CARM1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARM1Q86X55 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CARM1Q86X55 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARM1Q86X55 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms