Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG4DQ86TL0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG4DQ86TL0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms