Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF5Q86SE9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF5Q86SE9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF5Q86SE9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.4 ms