Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7H3

CATIP, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATIPQ7Z7H3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CATIPQ7Z7H3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CATIPQ7Z7H3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CATIPQ7Z7H3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CATIPQ7Z7H3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CATIPQ7Z7H3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CATIPQ7Z7H3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CATIPQ7Z7H3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CATIPQ7Z7H3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CATIPQ7Z7H3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CATIPQ7Z7H3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CATIPQ7Z7H3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CATIPQ7Z7H3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CATIPQ7Z7H3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CATIPQ7Z7H3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CATIPQ7Z7H3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CATIPQ7Z7H3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CATIPQ7Z7H3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CATIPQ7Z7H3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms