Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4K8

TRIM46, Tripartite motif-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM46Q7Z4K8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM46Q7Z4K8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM46Q7Z4K8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM46Q7Z4K8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms