Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATG9AQ7Z3C6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATG9AQ7Z3C6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
ATG9AQ7Z3C6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms