Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NEGR1Q7Z3B1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEGR1Q7Z3B1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEGR1Q7Z3B1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms