Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTOP3Q7RTS5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTOP3Q7RTS5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms