Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DENND5BQ6ZUT9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DENND5BQ6ZUT9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms