Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC73Q6ZRK6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC73Q6ZRK6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms