Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL4Q6ZR62 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTL4Q6ZR62 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL4Q6ZR62 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms