Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP6Q6ZN66 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP6Q6ZN66 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP6Q6ZN66 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms