Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYNE3Q6ZMZ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNE3Q6ZMZ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNE3Q6ZMZ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNE3Q6ZMZ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNE3Q6ZMZ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNE3Q6ZMZ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms