Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARA5Q6ZMJ2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms