Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMD2

SPNS3, Protein spinster homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3Q6ZMD2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SPNS3Q6ZMD2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPNS3Q6ZMD2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNS3Q6ZMD2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNS3Q6ZMD2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNS3Q6ZMD2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNS3Q6ZMD2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNS3Q6ZMD2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNS3Q6ZMD2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNS3Q6ZMD2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPNS3Q6ZMD2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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