Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00114Q6XXX2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms