Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4U4

SOSTDC1, Sclerostin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOSTDC1Q6X4U4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOSTDC1Q6X4U4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SOSTDC1Q6X4U4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOSTDC1Q6X4U4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOSTDC1Q6X4U4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOSTDC1Q6X4U4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SOSTDC1Q6X4U4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOSTDC1Q6X4U4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOSTDC1Q6X4U4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOSTDC1Q6X4U4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOSTDC1Q6X4U4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SOSTDC1Q6X4U4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOSTDC1Q6X4U4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOSTDC1Q6X4U4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOSTDC1Q6X4U4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOSTDC1Q6X4U4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOSTDC1Q6X4U4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOSTDC1Q6X4U4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms