Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIG3Q6UXM1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRIG3Q6UXM1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG3Q6UXM1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms