Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCD3Q6STE5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCD3Q6STE5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms