Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf48Q6RUI8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C19orf48Q6RUI8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms