Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L2Q6R6M4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP17L2Q6R6M4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L2Q6R6M4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms