Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCNV1Q6PIU1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNV1Q6PIU1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNV1Q6PIU1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms