Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO42Q6P3S6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO42Q6P3S6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO42Q6P3S6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 595.9 ms